違反體內機會主義和專性（有益）微生物群落之間的平衡會導致嚴重後果，所以必須恢復平衡。 在這種情況下，胃腸病專家提出了成人腸道生態失調的綜合治療方案 - 根據生物纖維化紊亂的原因以及臨床表現的強度來選擇藥物。
抗菌藥物用於成人腸道生態失調
有關藥物應特別謹慎，並且只有在對糞便進行實驗室檢測後才能得出結果，其結果顯示哪些細菌引起了生態失調，以及它們對各種類型的抗微生物製劑的敏感性。
根據檢測到的微生物選擇從抗生素組治療腸道菌群失調的有效藥物：
1.變形桿菌：
- Enterofuryl ;
- nevigramon;
- ersefuril;
- ftalazol;
- Sulgin。
2.腸球菌：
- 呋喃唑酮;
- 氯黴素;
- 停止亞爾;
- levovinizol;
- 氯黴素。
3.葡萄球菌和鏈球菌：
- 克拉黴素;
- 阿奇黴素;
- 交沙黴素;
- 慶大霉素;
- 新黴素;
- 丁胺卡那黴素;
- 卡那黴素;
- 鏈黴素;
- 妥布黴素;
- 奈替米星。
4.銅綠假單胞菌：
- 羧芐青黴素;
- 多粘菌素;
- 慶大霉素;
- 丁胺卡那黴素;
- 卡那黴素。
5.梭菌：
- trihopol;
- 甲硝唑;
- 萬古黴素;
- Editsin;
- Vanmiksan。
值得注意的是，生態失調的原因可以成為真菌。 在這種情況下，應使用抗真菌藥物替代抗菌藥物：
- Mikosist;
- 大扶康;
- Ambisome;
- 蘭美抒;
- Flukonorm;
- Amfotsil;
- 氟康唑;
- Terbinoks;
- Flyukozan;
- Amphoglucaminum;
- Terbizil;
- Ekzitern;
- Ampholip;
- Bramizil;
- 兩性黴素。
除了使用抗生素外，建議使用噬菌體。 它們是影響特定類型病原微生物的特殊病毒。 最有效的是：
- 蛋白質和蛋白質;
- 金黃色葡萄球菌;
- 銅綠假單胞菌;
- piobakteriofag。
除了治療成人腸道菌群失調 - 還有其他的準備工作
恢復微生物松解可以使兩大類特殊藥物。
益生元：
- Duphalac;
- 古德勒克;
- Normase;
- Laktusan;
- Prelaks;
- Eksportal;
- 乳糖醇;
- 希拉克復地
- 胃腸運輸。
製劑 - 用於治療成人生態失調的益生菌有幾種類型：
1.單組分，由一種類型的微生物組成：
- 乳酸桿菌;
- Bifidumbacterin;
- Kolibakterin。
2.多組分，含有幾種微生物：
- bifiform;
- 期Linex;
- Bifikol。
3.合生元，親和益生元的複合物：
- Maltodofilyus;
- Bifidobak;
- Laminolakt。
4.基於共生菌群和基本細菌以及對大多數抗生素免疫的菌株：
- Rioflora Immuno;
- 期Linex;
- Gastrofarm。
5.基因工程或重組，通過包含控制免疫細胞合成的克隆改變基因（α干擾素）產生：
- Bifiliz。
6.拮抗劑 - 由於自我繁殖而抑制病原菌增殖的主要微生物：
- Baktisporin;
- Enterol;
- Baktisubtil。
另外為了緩解不愉快的生態失調症狀
- 膽汁;
- 抗組胺藥;
- 解痙藥;
- 具有鎮痛作用的消炎;
- 發熱;
- 免疫調節劑 ;
- 螯合劑;
- 維生素。